Das Vorgehen in E-Business-Projekten weist einige Besonderheiten gegenüber dem Vorgehen in gewöhnlichen Softwareprojekten auf, da es sich nicht nur um das Reengineering von Softwarearchitekturen und Infrastrukturen handelt, sondern i.d.R. um das Reengineering des gesamten Unternehmens.